玛不错遗址之所以被视为改写西藏史前文化认知的重要发现，核心在于其在青藏高原腹地所达到的年代深度和文化连续性。根据公开资料，玛不错遗址是青藏高原腹地已发现海拔最高、年代最早的新石器时代遗址，其主体年代跨度约为距今约4800年至3000年。
在考古学研究的背景下，该遗址的意义在于填补了西藏中南部史前文化空白。通过对玛不错遗址的发掘和分析，首次构建出了西藏中部地区从距今约4800年至2000年的完整史前文化发展序列。
时间线上的关键证据体现在其分期研究上。首先，玛不错遗址的第一期文化遗存大致处于距今约4800年到4000年之间，这一阶段的先民以丰富的渔业资源作为主要的食物来源。随后进入的是“玛不错文化”的重要转型时期：第二期（距今约4000年到3300年左右）和第三期（距今约3300年到3000年）。在这一阶段，生存策略发生了显著变化，从单纯的渔猎转向了狩猎陆生动物，并且开始出现了麦类粮食。
进入遗址的第四期（距今约3000年到2000年），玛不错遗址展现出以大型石构生活遗迹为主的特征，这标志着聚落性质从新石器时代向早期金属时代的过渡。这种跨越多个经济和技术阶段的连续性，是其重要的学术价值所在。
除了本土的发展脉络，玛不错遗址还提供了关于区域交流的重要线索。出土了粟、稻、海贝、象牙等外来遗存，这些发现被认为是青藏高原史前时期与外部世界进行直接交流的物证。例如，粟的来源指向中国北方或青藏高原东部，这暗示着在史前时代存在跨区域的贸易通道或人群迁徙路线。
在物质文化层面，玛不错遗址展现出明显的文化继承性。其第二期陶器的平底特征与西藏东部的昌都卡若遗址（距今约5000至4000年）存在共性。更进一步地，玛不错遗址的陶器演变路径体现了吸收外部元素的特点，表现为“平底+圈足”到“平底+圜底”，这整合了昌都卡若遗址的平底传统以及拉萨曲贡遗址的圈足/圜底元素。
经济模式的研究也揭示了复合性。玛不错遗址的经济模式被界定为“本土资源+外来补给”的复合型结构，这表明其生存依赖于本地资源的开发，同时也通过贸易获取了粟、黍、麦等关键谷物。
此外，丧葬习俗的研究也提供了丰富的文化信息。已发掘的61座墓葬包括石棺墓和竖穴土坑墓等多种形制，其中记录了二次捡骨葬、俯身葬以及屈肢葬等不同的丧葬习俗，这些细节描绘了早期人群复杂的社会结构。
综上所述，玛不错遗址的价值不仅在于其极早的年代序列和完整的文化发展阶段划分，更在于它通过物证（如外来谷物、石器）和技术特征（如陶器风格的演变），描绘出了一幅青藏高原史前社会如何与外部世界互动、如何构建复合型经济体系的宏大图景。这些发现共同构成了对西藏史前文化认知的一次重要重塑。
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